智慧病理学研究所（Intelligent Pathology Institute of USTC）

位于中国科大附一院南区3号楼10、11层，实验室建筑面积约2400平方米。实施PI负责制、以各个独立实验室为单位开展学术研究,实验室主任为中科院院士卞修武。主要研究方向包括肿瘤微环境、肿瘤血管生成、肿瘤干细胞、病理生理学、人工智能在病理学中的应用等，尤其关注脑胶质瘤。实验室共计投放至少56台仪器设备，其中高端设备包括德国徕卡激光共聚焦显微镜TCS SP8、德国蔡司活细胞工作站Observer7、美国BD流式细胞仪 Canto II 等。

肿瘤研究中心（Cancer Research Center in USTC）

位于中国科大附一院南区3号楼12层，实验室建筑面积约1200平方米,中国工程院院士王红阳教授任实验室主任。目前涉及的研究方向为肿瘤的基础与临床研究，主要包括：肿瘤的炎-癌转化、信号网络调控和肿瘤诊断试剂研发；肿瘤相关的分子信号转导，肿瘤微环境中外泌体和微囊泡功能研究；肿瘤起始细胞的分子调控网络和治疗靶点研究等。实验室共计投放至少10台仪器设备，其中高端设备包括BioTek Lionheart FX活细胞工作站、BD LSRFORTESSA流式细胞仪、美国安捷伦Xfe96细胞能量代谢仪、德国蔡司LSM800单光子共聚焦显微镜等。

公共实验平台（南区）

位于中国科大附一院南区3号楼13层，实验室建筑面积约1200平方米。公共实验平台将坚持资源共享的原则服务于医院科研,2020年公共实验平台将购置48台/套中小型仪器设备，如凝胶成像系统、正置和倒置荧光显微镜、冰冻切片机等生命科学和医学研究常规实验设备。现已配备的高端仪器有流式细胞仪、荧光定量PCR仪、激光共聚焦显微镜、激光散斑血流仪、落地式超速离心机等。

智能纳米医学研究院（Intelligent Nanomedicine Institute）

位于中国科大附一院南区3号楼13层,由中国科学技术大学生命科学学院与中国科学技术大学附属第一医院共同组建，主要研究成员有中国科学院赵宇亮院士、国家杰出青年基金获得者陈春英研究员、国家杰出青年基金获得者尤业字教授、青年学者陈华兵教授、国家优秀青年基金获得者谷战军研究员、王育才教授以及肿瘤内科、肿瘤外科的主任医师。围绕智能纳米医学展开，研究方向主要包括智能传感器件、新型造影剂设计与应用以及智能纳米药物三个方面。实验室拥有齐全的实验平台，涵盖细胞生物学实验室、活体显微成像平台、药效评价平台、药物筛选平台等，并将结合中国科学技术大学现有资源，与中科大附属第一医院的临床医生合作开展纳米医学前沿基础科学研究和临床转化研究。

肝胆胰外科安徽省重点实验室（Anhui Province Key Laboratory of Hepatopancvreatobiliary Surgery）

位于中国科大附一院南区3号楼14层。实验室建筑面积约300平方米，中国科大附一院执行院长、党委副书记刘连新教授任实验室主任。主要研究方向包括肝细胞癌临床与基础研究、肝切除术加速康复外科临床研究、胆道疾病的基础与临床研究、胰腺疾病的基础与临床等。承担科大新医学“科研攀登计划”，已成为我省肝胆胰外科领域最重要的医疗、科研和人才培养基地之一。实验室共计投放至少56余台仪器设备，其中高端设备包括艾森RTCA DP实时无标记细胞分析仪、OLYMPUS智能生物图象导航仪（显微镜）FSX100等。

脑功能与脑疾病安徽省重点实验室（Anhui Key Laboratory of Brain Function and Diseases）

位于中国科大附一院南区3号楼14层,实验室建筑面积约300平方米，中国科大附一院神经外科主任牛朝诗教授任实验室主任。实验室坚持专科稳定的研究方向，继续开展帕金森病、脑胶质瘤、难治性癫痫、功能性脑疾病神经网络等的基础研究，为临床应用提供理论根据和实验基础。现有高端设备包括远明GE/AI 680RGB超灵敏多功能成像仪、远明奥林巴斯/CKX53+DP74普通倒置荧光显微镜等。

血液和细胞治疗研究所（Blood and Cell Therapy Insititute in USTC）

血液和细胞治疗研究所成立于2018年6月，位于中国科大附一院南区3号楼15层，建筑面积约1200平方米，中国科大生医部部长程临钊教授任实验室主任。实验室主要研究方向有程临钊教授团队开展的造血干细胞诱导红细胞与血小板研究，以及中国科大附一院血液科孙自敏教授团队开展的造血干细胞移植的基础研究和临床应用。实验室聘请国内外多名从事造血干细胞基础研究知名专家组成学术委员会，由实验血液学国家重点实验室主任程涛教授任主任委员。实验室主要PI有：中国科大魏海明教授、倪芳教授，中国科大附一院祝怀平研究员、朱小玉主任医师、郑昌成主任医师、王兴兵主任医师等。实验室设备齐全，其中高端设备包括美国BD LSR FORTESSA分析型流式细胞仪、美国NanoString nCounter SPRINT荧光条形码多重基因分析系统等。

脑衰老与脑疾病研究中心（Institute on Aging and Brain Disorders）

位于位于中国科大附一院南区3号楼16层，建筑面积约1200㎡。中心负责人是申勇教授和熊伟、刘强教授。开展衰老以及相关的神经退行性疾病研究，如阿尔兹海默病、脑小血管病等。实验室拥有齐全的实验平台，涵盖分子生物学实验室、细胞生物学实验室、电生理实验室、单细胞质谱及质谱成像平台、单细胞测序平台、诊断标记物筛选平台等。并结合中国科学技术大学脑资源库，协同临床科室建立老年痴呆相关的临床研究队列与社区研究队列，开展血液、脑脊液等样本收集工作，从而在此基础上研究各类神经退行性疾病的早期诊断标记物。除此以外，实验室还将推进多学科交叉和转化医学研究，使基础研究成果更有效、更及时地转化为临床应用，包括利用新技术推动脑疾病诊断和治疗等。